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1 培养方向不同
学术型硕士教育以培养教学和科研人才为主，授予学位的类型主要是学术型学位;
专业型硕士是国家为了克服学术型硕士的不足新增的一种新硕士，培养的是市场紧缺的应用型人才。
2 招生条件不同
学术型硕士则不需要报考者有一定年限的工作经历。
国家09年新增的一月份统考的全日制专业型硕士并不要求工作经验，招生条件跟原来的学术型硕士一样，应届生可以报考。
3 入学难度不同
学术型硕士的全国硕士研究生入学统一考试(统考)完全是严进宽出的代表。据了解，一些名校热门专业的录取比例甚至为70：1。而一些二流学校的冷门专业却年年招不满。因此，入学难度取决于考生报考的学校和专业。
这两大国家级别考试的专业考试，是由各招生单位自行命题、阅卷。不同专业的入学难度各不相同，热门专业相对难一些。此外，“ 联考”和“统考”的难度也不一样，由于“统考”考生远多于“联考”考生，考试竞争激烈程度自然也大。不过，“联考”的考试虽容易，但录取时更看重申请者的工作背景和经验。
4 学习方式不同
学术型硕士： 全日制学习。一般为3年。
专业硕士：脱产全日制学习，学制2-3年
5 学习费用不同
学术型硕士录取为国家计划内(非定向、定向)的硕士生。从2014年秋季学期起，所有的研究生开始自费。专业硕士从2010年开始基本跟全日制学术型硕士一样，录取为国家计划内(非定向、定向)的硕士生按国家规定享受免学费待遇。录取为国家计划外(委托培养、自筹经费)的硕士生须缴纳学费，一般为8000元/年，不同专业有所不同。对于自筹经费生、特困生等考生可通过申请国家助学贷款或者商业贷款缓解学费的压力。
6 社会认可度不同
学术型硕士：由于是全日制正规大学硕士毕业，拥有学历、学位双证，因此社会对这样的毕业生的认可度非常高。但企业在招聘时也会考虑到全日制硕士研究生的弱点：光有理论，经验不足。特别对于硕士专业与本科专业方向完全不同，又从无相关工作经验的求职者，企业会有所顾忌。建议这类毕业生通过实习、兼职或考职业证书来加强自身的竞争力。
专业型硕士：专业型硕士是偏向于应用型的学科，主要培养高层次应用型专业人才，这个与学术型硕士有很大的不同，学术型硕士往往培养科研型人才，主要往科研和理论方向进行发展，培养的方向不太一样。专业型硕士在一些专业领域上面认可度很高，因为专业型硕士属于高级专门人才，这正是满足专业领域的强烈需求，如法律硕士、会计硕士等就颇受青睐。
而且现在专业型硕士正处于“扩招”当中，加上考研人数不断增加，想要考上研究生的难度有所增加，如果一味的追求学术型硕士，考不上的概率是很大的，学术型硕士的考研难度不低，相对的，专业型硕士考研难度会低一些，两者进行比较，于是有不少人就选择报考专业型硕士，看起来似乎没有学术型硕士那么好，但是适合自己的才是最好的。
专业型硕士已不是刚发展起来那会，没有得到社会的太多认可，现在不一样了，社会认可度大大提高，同时，发展前景也十分乐观，从就业前景的角度来看，是不输于学术型硕士的，因而有越来越多的人愿意报考专业型硕士，而学术型硕士也不再是“唯一”的选择，考研人可根据自身实际情况选择报考学术型硕士还是专业型硕士，选择变多，实用性更高。
